A Superintendência de Navios da DHN (DHN-03) foi criada em 1990 como um componente organizacional, com características de Estado-Maior, para cuidar dos assuntos afetos aos navios. Permaneceu na Ilha Fiscal após a transferência dessa Diretoria para a Ponta da Armação, em fevereiro de 1993.

A Superintendência de Navios da DHN (DHN-03) foi criada em 1990 como um componente organizacional, com características de Estado-Maior, para cuidar dos assuntos afetos aos navios. Permaneceu na Ilha Fiscal após a transferência dessa Diretoria para a Ponta da Armação, em fevereiro de 1993.

Em 31 de outubro de 1996 foi transformada no Grupamento de navios Hidroceanográricos.
Em março de 1998 transferiu-se para a Ponta da Armação, ocupando instalações provisórias
até janeiro de 1999, quando passou à sua sede atual. Juntamente com a DHN, o CHM, o CAMR
e a BHMN, integra o Complexo Naval da Ponta da Armação (CNPA). Com a publicação da Portaria
nº 99 de 27 de março de 2002 do Comandante daMarinha, que aprova as Normas Gerais para o
Embarque/Tropa e Tempo de Viagem/Operação, passou-se a contar tempo de embarque para o pessoal
lotado no GNHo. Essa era um aspiração que remotava à época de sua criação, em 02 de setembro de
1996, em face das atividades aqui exercidas, similares as de outros grupamentos.