A Diretoria de Engenharia Naval (DEN), foi regulamentada inicialmente com esta denominação pelo Decreto nº 16.601, de 17 de setembro de 1924. Foi reorganizada pelos Decretos nº 21.994, de 20 de outubro de 1932, e nº 6.176, de 27 de agosto de 1940, e reestruturada com a denominação de Diretoria de Engenharia da Marinha (DE) pelo Regulamento aprovado pelo Decreto nº 32.416, de 18 de março de 1953, posteriormente substituído pelo Regulamento aprovado pelo Decreto nº 46.418, de 14 de julho de 1959, surgindo a nova sigla (DEM), alterado pelo Decreto nº 53.393, de 06 de janeiro de 1964. Foi novamente reorganizada pelo Decreto nº 62.860, de 18 de junho de 1968, que estabeleceu a Estrutura Básica do Ministério da Marinha, sendo o Regulamento conseqüente aprovado pelo Decreto nº 68.225, de 12 de fevereiro de 1971. Foi reestruturada com a atual denominação de Diretoria de Engenharia Naval (DEN) pelo Decreto nº 77.784, de 08 de junho de 1976, tendo o seu Regulamento sido aprovado pelo Decreto nº 81.797, 15 de junho de 1978. Revogado o Decreto de Regulamentação, passou a ter sua organização e atividades em conformidade com o Regulamento aprovado pela Portaria nº 0062, de 29 de outubro de 1992, do Chefe do Estado-Maior da Armada. Revogada a citada Portaria, passou a ter sua organização e atividades em conformidade com o Regulamento aprovado pela Portaria nº 0005, de 08 de janeiro de 1997, do Chefe do Estado-Maior da Armada. Revogada pela Portaria nº 104, de 08 de abril de 1999, do Chefe do Estado-Maior da Armada, passa a ter sua organização e atividades em conformidade com o Regulamento aprovado pela Portaria nº 0022, de 09 de abril de 1999, do Diretor-Geral do Material da Marinha. Revogada a citada Portaria, passou a ter suas atividades e a organização estruturadas pela Portaria nº 72, de 14 de agosto de 2002, do Diretor-Geral do Material da Marinha. Revogada essa última Portaria, passa ter suas atividades e a organização estruturadas pelo Regulamento aprovado pela Portaria nº 101, de 6 de outubro de 2003, do Diretor-Geral do Material da Marinha. Revogada a citada Portaria, passa a ter sua organização e atividades em conformidade com o presente Regulamento, aprovado pela Portaria nº 46 de 3 de março de 2008, do Diretor-Geral do Material da Marinha. O regulamento atualmente em vigor foi aprovado pela Portaria nº 312/2013, de 18 de julho de 2013, do Diretor-Geral do Material da Marinha.