O Batalhão de Controle Aerotático e Defesa Antiaérea (BtlCtAetatDAAe) foi ativado em 28 julho de 2003. Suas origens, contudo, remotam à década de 1970, quando foi criada a Bateria de Canhões Automáticos Antiaéreos, subordinada ao então Batalhão de Comando da tropa de reforço, possuindo em sua dotação os confiáveis e tradicionais Canhões Bofors 40mm/L60.

Ao final da década de 1980, a incorporação do sistema BOFI-GIRAFFE deu novas dimensões à defesa antiaérea para a Força de Fuzileiros da Esquadra. A subunidade recebeu a nova denominação de Bateria de Canhões Antiaéreos, passando à subordinação do então Grupo de Artilharia.

Em 1995, foi transformada em Organização Militar independente, com semi-autonomia administrativa, com a denominação de Bateria de Artilharia Antiaérea, que recebeu em seguida o sistema de Mísseis Superfície-Ar MISTRAL.

Em 2003, ocorreu a ativação do Batalhão, concretizando o resultado de estudos realizados para a modernização do Corpo de Fuzileiros Navais, sendo esta uma das mudanças mais inovadoras, por permitir que todas as ações referentes á utilização do espaço aéreo pelos Grupamentos Operativos de Fuzileiros navais ficassem concentrados em uma única organização militar, Subordinada a Divisão Anfíbia.

O BtlCtAetatDAAE, atualmente, é a organização militar mais jovem da FFE e encontra-se em franco processo de consolidação da doutrina de emprego do Componente de Combate Aéreo. Prova disso foi o emprego pioneiro e bem sucedido do Pelotão de Veículos Aéreos Não-Tripulados (VANT) tático, em apoio à manobra das companhias de primeiro escalão do Componente de combate terrestre da Força de Desembarque.

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